Arı bağırsağı, koloninin genel sağlığını doğrudan etkileyen en önemli yapılardan biridir. Sindirim, bağışıklık ve besinlerden yararlanma süreçleri büyük ölçüde bağırsak dengesine bağlıdır. Bu dengede oluşan bozulmalar, arının dışarıdan güçlü görünmesine rağmen kısa sürede zayıflamasına neden olabilir.
Bağırsak florası; yararlı mikroorganizmalar, pH dengesi ve sindirim enzimleriyle birlikte çalışır. Dengenin bozulması durumunda arı, aldığı besinden yeterince faydalanamaz ve bağışıklık sistemi zayıflar. Bu durum özellikle stresli dönemlerde hastalıklara karşı direncin düşmesine yol açar.
Tek tip besleme, bozulmuş şuruplar, yanlış katkılar ve mevsimsel stres faktörleri bağırsak dengesini olumsuz etkileyebilir. Dengesi bozulan kolonilerde sönüklük, yavru atımında düzensizlik ve performans kaybı sık görülür.
Arı bağırsağında dengeyi korumak, koloninin uzun vadeli sağlığı için temel bir unsurdur. Amaç kısa süreli toparlanma değil, sürdürülebilir ve güçlü bir koloni yapısı oluşturmaktır.